典型的急性胆囊炎临床上较容易诊断，一些轻症病例或发病早期容易误诊，因临床上能引起右上腹疼痛的疾病很多。比如，急性病毒性肝炎，急性胰腺炎，急性阑尾炎，胆道蛔虫，消化性溃疡穿孔，以及右心衰竭等疾病常与急性胆囊炎相混淆。

(1)急性胰腺炎：该病可继发于急性胆囊炎和胆管炎，腹痛较急性胆囊炎剧烈，呈持续性，范围较广并偏向腹部左侧，压痛范围也较为广泛，血与尿淀粉酶一般均升高。
(2)急性阑尾炎：高位急性阑尾炎与急性胆囊炎的不同点主要在于详细分析病史和体征。
(3)胆道蛔虫病：发病突然，腹痛在剑突下呈阵发性绞痛，呕吐频繁，常有吐蛔虫史，腹痛可自行缓解。早期上腹部压痛不明显，无腹肌紧张。
(4)溃疡病穿孔：病人多有胃、十二指肠溃疡史，腹痛发作突然，呈持续性，较急性胆囊炎剧烈，并很快波及整个腹部，腹肌强直，但很少有呕吐现象。因较小的十二指肠穿孔，或穿孔后很快形成一个局限的炎性病灶时，容易与急性胆囊炎混淆。
(5)肝脓肿：位于肝右叶前下方的脓肿，触诊时易把肿大的肝脏误认为胆囊炎性包块。
另外，青年女性患者应与fitz-hugh-curtis综合征相鉴别，这是由于急性输卵管炎所伴发的肝周围炎，可有右上腹疼痛，易与胆囊炎相混淆，鉴别点在于妇科检查可发现附件有压痛，宫颈涂片可见淋球菌或沙眼包涵体。