大多数的消化性溃疡可以通过清除幽门螺杆菌或者停止使用非甾体类抗炎药而得到治愈并防止复发。药物的使用如下：

减少胃酸分泌治疗胃溃疡；如果确认幽门螺杆菌感染通过清除胃内壁的细菌来治疗溃疡；通过保护胃粘膜或者上段小肠（十二指肠）来防治非甾体类抗炎药对其的损伤。

药物的选择减少胃酸分泌的药物减少胃酸分泌的药物适用于所有的消化性溃疡。

质子泵抑制剂：如奥美拉唑、兰索拉唑缓释剂、雷贝拉唑、泮多拉唑和耐信，它们可以减少胃酸的分泌（其效果好于h2受体阻滞剂）。

h2受体阻滞剂：如西咪替丁、善得胃（雷尼替丁）、法莫替丁和爱希（尼扎替丁），它们也可以减少胃酸的分泌。

抗酸剂：中和胃酸，但是其效应比质子泵和h2受体阻滞剂差一些。

如果是由幽门螺杆菌引起的消化性溃疡，可是使用质子泵抑制剂联合抗生素来治疗。

幽门螺杆菌抗生素医生开具的联合用药方案可以治疗幽门螺杆菌，药物联合治疗包括至少两种抗生素、一种质子泵抑制剂有些时候还可以联合一种铋化合物。

预防溃疡的药物有些药物是用来保护因为长期应用非甾体类抗炎药或者阿司匹林引发的胃部损伤。这些药物称为前列腺素类似物如胶体次枸橼酸铋，它们可以预防非甾体类抗炎药诱导的溃疡。

需要考虑的问题胃部的溃疡（胃溃疡）的治愈时间比上段小肠（十二指肠）溃疡要长。

对于因为感染幽门螺杆菌诱发的消化性溃疡，医生建议采用联合治疗包括至少两种抗生素和一种抗酸剂（通常是质子泵抑制剂）有时还需要配合铋化合物。这种合并用药的治愈率大概为80%-90%而且可以显着减少复发的几率。

日常可以备用一些h2受体阻滞剂和质子泵抑制剂这些非处方药物。如果应用非处方类的抗酸剂如奥美拉唑或者法莫替丁10-14天就可以帮助治疗这些症状，如果症状很严重，那就需要去及时看医生。