可选用中药辅助治疗，治疗原则为：温病，卫、气、营血和三焦辨证论治。

糖皮质激素的应用：建议应用激素的指征为：有严重中毒症状；达到重症病例标准者。应有规律使用，具体剂量根据病情来调整。儿童慎用。

非典型肺炎的治疗治疗上早期选用大环内脂类、氟喹诺酮类、β－内酰胺类、四环素类等，如果痰培养或临床上提示有耐药球菌感染，可选用（去甲）万古霉素等。

非典型肺炎的治疗对症治疗：有发热超过38.5℃者，全身酸痛明显者，可使用解热镇痛药。高热者给予冰敷、酒精擦浴等物理降温措施。咳嗽、咳痰者给予镇咳、祛痰药。有心、肝、肾等器官功能损害，应该作相应的处理。气促明显、轻度低氧血症者应早给予持续鼻导管吸氧。儿童忌用阿司匹林。

非典型肺炎的治疗一般性治疗：休息，适当补充液体及维生素，避免用力和剧烈咳嗽。密切观察病情变化（多数病人在发病后14天内都可能属于进展期）。定期复查胸片（早期复查间隔时间不超过3天）、心、肝、肾功能等。每天检测体表血氧饱和度。